L’hepatitis C crònica s’associa molt sovint a manifestacions de lesions extrahepàtiques pel VHC, generalment a través d’un mecanisme immunitari. Algunes, les més freqüents, són fàcils de reconèixer, com la crioglobulinèmia mixta que cursa amb vasculitis de vasos petits, o la glomerulonefritis membranoproliferativa que cursa amb un augment de la creatinina sèrica i la hipertensió arterial. De vegades aquesta manifestació extrahepàtica és la primera que es detecta, quan l’hepatitis havia passat desapercebuda.

D’altres manifestacions extrahepàtiques associades a la infecció pel VHC són:

Púrpura trombocitopènica
Síndrome antifosfolipídica
Fibrosi pulmonar idiopàtica
Alteració de les glàndules salivals i lacrimals (síndrome de Sjögren)
Liquen pla
Porfíria cutània tardana
Fibromiàlgia

Tot i que no s’ha establert un vincle directe entre la fibromiàlgia i l’hepatitis C, hi ha més persones que tenen fibromiàlgia entre la població amb hepatitis C que entre la població general. L’hepatitis C i la fibromiàlgia comparteixen molts símptomes, com la fatiga i els dolors musculars i articulatoris.