El CSIC i Ibercivis llancen un projecte de ciència ciutadana que busca fàrmacs contra el coronavirus

El projecte COVID-PHYM es basa en l’ajut dels ordinadors de milers de persones voluntàries.

El Consell Superior d’Investigacions Científiques (CSIC) i la Fundació Ibercivis han llançat el projecte de ciència ciutadana ‘COVID-PHYM’ per trobar un fàrmac utilitzat en el tractament d’altres malalties virals que actuï contra el nou coronavirus.

Donat que alguns medicaments en ús ja han demostrat ser suficientment segurs per a la salut humana, podrien estar disponibles per tractar a pacients amb COVID-19 “molts abans que un compost de nova creació” i, per tant, accelerar el control de la pandèmia.

Sota aquesta premissa, el grup Biophym de l’Institut d’Estructura de la Matèria del CSIC s’ha proposat realitzar simulacions de la interacció de fàrmacs emprats contra l’ebola, la infecció per VIH, la grip o l’hepatitis B amb la maquinària de replicació del genoma del virus SARS-Co-V.

Per això recorrerà a tècniques informàtiques i a l’ajut dels ordinadors de milers de persones voluntàries connectades a través de la plataforma de computació distribuïda d’Ibercivis. Aquestes operacions mostraran si alguna de les molècules aconsegueix inhibir una proteïna clau en la multiplicació del virus denominada ‘ARN polimerasa dependent de ARN’.

De ser així, el fàrmac es convertiria en un candidat idoni per ser provat en assajos clínics amb persones. “Disposar de fàrmacs eficaços contra el coronavirus és essencial per disminuir la severitat i la mortalitat de la malaltia. La proteïna seleccionada com a diana juga un paper central en la replicació i transcripció del material genètic del virus; si es neutralitza, es pot aturar la propagació del virus a l’organisme i ajudar a la curació”, ha explicat el líder del grup Biophym, Javier Martínez de Salazar.

No obstant, adverteix, buscar un compost capaç de neutralitzar una proteïna concreta és com provar un enorme nombre de claus per obrir un pany i, quan aquest procés es simula per mitjans informàtics, exigeix una gran potència de càlcul.

“Existeixen models basats en química-física que poden predir l’eficàcia dels compostos mitjançant tècniques computacionals, anomenades in silico, abans que siguin provats en assajos clínics. Però aquests models impliquen realitzar centenars de milers de càlculs per mesurar la força de la interacció de cadascuna de les possibles associacions entre el fàrmac i la proteïna”, ha apuntat un dels investigadors del grup, Javier Ramos Díaz.

Un supercomputador ciutadà contra la pandèmia

Un ordinador convencional trigaria diversos anys en executar els càlculs necessaris per dur a terme la investigació. Per això, el projecte comptarà amb el suport dels milers d’ordinadors personals que formen part de la plataforma de computació distribuïda d’Ibercivis (‘Ibercivis BOINC’), a la qual qualsevol persona que vulgui col·laborar es pot unir.

Les operacions es dividiran en petits paquets que s’enviaran a cada dispositiu. D’aquesta forma, s’assolirà una capacitat de càlcul similar a la d’una supercomputadora i es podran desenvolupar totes les activitats del projecte.

Els voluntaris i voluntàries només han de descarregar el programa BOINC, una aplicació de codi obert desenvolupada per la Universitat de Berkeley, i unir-se a ‘Ibercivis BOINC’ en el moment de la instal·lació. Al fer-ho, podran escollir fàcilment quan i com participar.

Per exemple, qui no vulgui que la capacitat de càlcul del seu ordinador es vegi afectada mentre l’usa, només ha de deixar la configuració per defecte per a què el programa s’executi únicament en els temps de pausa, quan salta el salvapantalles.

A l’activar-se BOINC, l’ordinador rebrà una col·lecció de dades i les instruccions per analitzar-los, i els resultats obtinguts es tornaran al projecte per ser estudiats per l’equip investigador.

“De la cerca de vida extraterrestre a la lluita contra el coronavirus, lluny de ser un experiment, la computació distribuïda és una realitat que en les últimes dues dècades ha permès desenvolupar nombroses investigacions que demandaven una gran capacitat de processament”, ha dit el director executiu d’Ibercivis, Francisco Sanz.

Font: infosalus.com

Notícia traduïda per l’ASSCAT