Desenvolupen una equació matemàtica que podria predir i detectar el càncer de fetge

Combinant la seqüenciació de l’ARN, la bioinformàtica i el modelat matemàtic, investigadors de la Facultat de Medicina de la Universitat de Califòrnia a San Diego i del Moores Cancer Center (Estats Units) han identificat un canvi transcriptòmic sobtat que fa que el teixit hepàtic sa es torni cancerós.

El descobriment es va usar per desenvolupar una eina analítica quantitativa que avalua el risc de càncer en pacients amb malaltia hepàtica crònica i per predir les etapes i el pronòstic del tumor en pacients amb càncer hepàtic.

“Degut a que no tenim un medicament eficaç per tractar el càncer de fetge en les seves últimes etapes, la detecció precoç del càncer de fetge, quan el tumor és de menys de 10 mil·límetres, permet als oncòlegs tractar millor, extirpar quirúrgicament i destruir les cèl·lules cancerígenes. Per primer cop, tenim una equació matemàtica que pot predir quan les cèl·lules sanes del fetge es tornen cancerígenes i, el que és més important, som capaços de detectar cèl·lules cancerígenes abans que els tumors siguin visibles en un entorn clínic estàndard”, explica Gen-Sheng Feng, autor principal del treball, que s’ha publicar a la revista Proceedings of the National Academy of Sciences.

La nova eina es va centrar en l’anàlisi dels grups de factors de transcripció. Els factors de transcripció són proteïnes que s’uneixen a seqüències específiques d’ADN per dirigir quins gens han d’activar-se o desactivar-se en una cèl·lula. Mitjançant el mesurament quantitatiu dels canvis en els factors de transcripció, el grup d’investigació va recollir les dades de seqüenciació d’ARN recopilades en les etapes prèvies al càncer i de càncer de models amb ratolins amb diferents formes de càncer de fetge i malalties hepàtiques cròniques com l’esteatosi, la fibrosi i la cirrosi.

L’anàlisi va trobar 61 grups de factors de transcripció que estaven regulats a l’alça o a la baixa en ratolins amb càncer i fins i tot va identificar factors de transcripció que s’havien reportat prèviament en el càncer de fetge.

A continuació, els investigadors van dissenyar una anàlisi completa d’un transcriptoma de cèl·lules hepàtiques, la col·lecció completa de seqüències d’ARN en una cèl·lula. Això va permetre a l’equip comparar l’expressió dels grups de factors de transcripció en fetges sans i en aquells amb malalties hepàtiques cròniques en diverses etapes per identificar quan les cèl·lules es van tornar cancerígenes en ratolins.

Després de desenvolupar el model matemàtic usant dades de ratolins, els investigadors van aplicar l’eina analítica a una base de dades pública per tornar a analitzar les dades en pacients humans i van poder identificar quines persones tenien càncer i quines tenien malaltia hepàtica crònica. En els pacients amb cirrosi, que estan en alt risc de desenvolupar càncer, van poder veure una puntuació positiva en l’índex tumoral i, en alguns casos, nòduls tumorals que encara no eren visibles a la clínica.

“Aquest enfoc matemàtic pot convertir-se en una avaluació del risc i en una eina de diagnòstic precoç del desenvolupament del càncer de fetge per a una major població de persones que viuen amb malaltia hepàtica crònica, en particular els que tenen cirrosi. L’anàlisi d’individus d’alt risc pot tenir una aplicació important en la medicina de precisió. I, amb major desenvolupament i optimització, aquesta eina podria ser modificada per predir el desenvolupament d’altres càncers”, conclou Feng.

Font: infosalus.com

Notícia traduïda per l’ASSCAT